| Thèse | De la ville à l'Université. Réformes religieuses et pouvoirs en France (XVIe-XVIIe siècles) | Auteur : Amalou, Thierry (1966-....) | 2020 |
| Article | Écrire ou réécrire l’histoire de la Sorbonne ? Les filières historiographiques et leur genèse depuis le XVIIe siècle | Auteur : Amalou, Thierry (1966-....) | 2019 |
| Contribution | Marc Venard, un maître de l'histoire religieuse du XVIe siècle | Auteur : Amalou, Thierry (1966-....) | 2019 |
| Contribution | Le bannissement d'un chef ligueur. Gilbert Génébrard, archevêque d'Aix, devant le parlement de Provence | Auteur : Amalou, Thierry (1966-....) | 2016 |
| Contribution | Le clergé français et les états généraux de Blois en 1588 : théologiens ligueurs contre prélats de cour ? | Auteur : Amalou, Thierry (1966-....) | 2015 |
| Monographie | Le lys et la mitre : loyalisme monarchique et pouvoir épiscopal pendant les guerres de religion, 1580-1610 | Auteur : Amalou, Thierry (1966-....) | 2007 |
| Monographie | Une concorde urbaine : Senlis au temps des réformes, vers 1520-vers 1580 | Auteur : Amalou, Thierry (1966-....) | 2007 |