| Monographie | Marseille l'italienne : histoires d'une passion séculaire. Catalogue de l'exposition, Archives municipales de Marseille, 25 septembre 2021-12 mars 2022 | Directeur de publication : Boutier, Jean (1953-....) ; Mourlane, Stéphane (1970-....) | 2021 |
| Contribution | Le séjour romain des jeunes «grands touristes» au XVIIIe siècle | Auteur : Boutier, Jean (1953-....) | 2018 |
| Thèse | Agir par le verbe. Mémoires et mémorialistes des guerres de Religion | Auteur : Morgant Tolaïni, Bruno (1984-....) | 2018 |
| Thèse | Expériences ordinaires de la peste. La société marseillaise en temps d'épidémie (1720-1724) | Auteur : Beauvieux, Fleur (1986-....) ; Directeur de publication : Boutier, Jean (1953-....) | 2017 |
| Thèse | Marseille et sa classe dirigeante à la Renaissance (env. 1460-env. 1560). D'une principauté méditerranéenne au royaume de France | Auteur : Maret, Auderic (1982-....) | 2017 |
| Monographie | Le accademie nobiliari francesi tra progetto e realtà (1570-1750) | Auteur : Bruschi, Andrea (1977-....) ; Préfacier : Boutier, Jean (1953-....) | 2015 |
| Thèse | Les chirurgiens et l'organisation sanitaire contre la peste à Marseille : 17e-18e siècles | Auteur : El Hadj, Jamel (19..-....) | 2014 |
| Article | Dans les «armoires» de Baluze : constitution, organisation et pratiques des archives épistolaires d’un savant au Grand Siècle | Auteur : Boutier, Jean (1953-....) ; Bruschi, Andrea (1977-....) | 2013 |
| Article | Utiliser, archiver, éditer. Usages savants de la correspondance en Europe, XVIIe-XVIIIe siècles | Auteur : Boutier, Jean (1953-....) ; Chapron, Emmanuelle (1976-....) | 2013 |
| Article | Utiliser, archiver, éditer. Usages savants de la correspondance en Europe XVIIe-XVIIIe siècles [dossier] | Directeur de publication : Boutier, Jean (1953-....) ; Chapron, Emmanuelle (1976-....) | 2013 |
| Contribution | Institutions royales et références italiennes : l'académie pour l'éducation de la noblesse à Aix-en-Provence au début du XVIIe siècle | Auteur : Boutier, Jean (1953-....) | 2008 |
| Monographie | Atlas de l'histoire de France. La France moderne, XVIe-XIXe siècle. Cartographie de Guillaume Balavoine. Sous la dir. de Jean Boutier | Directeur de publication : Boutier, Jean (1953-....) ; Éditeur scientifique : Balavoine, Guillaume | 2006 |